杰克、莉莉、艾莉丝和汤姆带着从神秘实验室中获得的宝贵发现，马不停蹄地赶回联盟总部。一路上，他们的心情既兴奋又紧张，不知道这些新的线索会给联盟带来怎样的变革。
当他们的飞船降落在联盟总部的停机坪时，早已等候在那里的联盟科学家们立刻围了上来。杰克等人顾不上休息，便开始向科学家们介绍他们的发现。
“这个实验室中关于神秘武器的研究资料比我们之前找到的更加详细，而且我们还发现了一些可能控制奇怪生物的装置。”杰克神情严肃地说道。
莉莉接着补充道：“那些奇怪生物非常强大，如果不是我们及时找到了控制它们的源头，后果不堪设想。”
艾莉丝则拿出一些记录着实验室数据的设备：“我们对那个实验室进行了详细的扫描和记录，这里面可能隐藏着更多关于古老文明的秘密。”
汤姆也说道：“这次的发现对我们改进新型武器肯定会有很大的帮助。”
联盟的科学家们听后，立刻投入到对这些新发现的研究中。杰克、莉莉、艾莉丝和汤姆也没有闲着，他们分别加入不同的研究小组，协助科学家们进行分析和解读。
在研究过程中，他们遇到了许多难题。神秘武器的原理极其复杂，需要耗费大量的时间和精力去理解。而那些奇怪生物的来源和特性也让科学家们摸不着头脑。
“这个神秘武器的能量来源到底是什么？为什么它会有如此强大的威力？”一位科学家皱着眉头问道。
莉莉思考了片刻后回答道：“根据我们在实验室中的发现，这个神秘武器似乎利用了一种特殊的能量物质，这种物质可能与神秘星球的能量场有关。”
艾莉丝也发表了自己的看法：“那些奇怪生物的身体结构非常奇特，它们可能是经过某种基因改造或者生物机械融合而成的。”
汤姆则专注于新型武器的改进：“我们可以尝试将神秘武器的技术应用到我们的新型武器中，提高其威力和稳定性。”
杰克则负责协调各个研究小组的工作，确保研究进度顺利进行。“大家要密切合作，我们的时间不多，敌人随时可能再次发动攻击。”
经过一段时间的努力，他们终于取得了一些重要的突破。科学家们成功地破解了神秘武器的部分原理，并且开始尝试制造出类似的武器。同时，他们也对那些奇怪生物有了更深入的了解，找到了一些应对它们的方法。