当贺珍举旗反清之时，他又率部响应，最终还是成为了反清势力的一员。
以上三位，和刘体纯关系显然都不怎么样，甚至可以说仇怨很深，但接到这三位“老朋友”的求援信后，顾全大局的刘体纯，还是看在他们都正在与清军拼死作战的份上，于隆武二年（顺治三年）三月，率军北上入陕，首先攻克商州。
后在隆武二年夏，刘体纯在陕南与贺珍、孙守法、武大定等人会师，攻占兴安州，他们就此在陕西建立了一个反清同盟，共同抗击清军。
可惜之后，进攻四川的豪格大军，途经陕西，贺珍、刘体纯的军队，不是豪格麾下精锐清军的对手，被击败，损失惨重，只好暂且蛰伏，或者陆续退入四川。
今年四月，没有退往四川的孙守法在接连战败后，终于为清陕西三边总督孟乔芳所杀。
就这样，一度因贺珍等人反正而震动的陕西，在清军的严酷镇压之下，再次安定下来。
而在四川击毙张献忠，赶跑孙、李等大西军余部的豪格大军，由于四川地区饱受战乱，尤其是受到晚期张献忠这样处于疯癫状态下以至于在极度愤怒的状态下杀川人六万万有奇的狠人之祸害，太过于荒废残破，社会生产几乎完全停顿，无法解决大量清军的粮饷供应。
故豪格只留下少量清军驻守四川，然后亲自率领他的主力军队退回了陕西，意图经陕西北返京师。
豪格大军离开后的四川清军，由于兵力单薄，粮饷不足，只得收缩兵力，将占领区域收缩到川北保宁府一带，四川大部分地区处于“军阀大乱斗”的严重混乱状态之下。
由于豪格北返，陕西清军势力更加强大，本就元气大伤的本地抗清势力愈发处于劣势。
纵观永历元年（顺治四年）四月的天下局势，因为四处派遣间谍而有着强大情报能力的朱由桹，可以清楚地看到清军的战线维持在了福建、江西中北部、湖广北部、四川北部。
朱由桹判断，在未来至少一二年的时间内，清军没有能力在各个方向上继续向南推进。
最西边就不说了，陕西刚刚经历贺珍等人的反正，虽然贺珍、刘体纯等人被击败，可陕西清军也伤亡颇大，需要时间休整，豪格大军在外征战一年多，计划回京休整，本就破败的四川还乱成一锅粥，或许在一定程度上也可以阻挡清军南下的脚步。
江西方向，纵使明军已经收复了江西南部南安赣州两府一段时间，可南昌的金声桓还是没有立即集合军队南下，完全是一副稳坐钓鱼台的模样，显然是心存了观望之心。
福建方向，在隆武帝蒙难、博洛率领大军携带郑芝龙等人北返之后，原先唐鲁对立的局面，发生了扭转，大多依旧志在抗清复明的文官武将、士绅百姓，在难以得到广东朱由桹即位确切消息的情况下，以还存活着的、近在咫尺的监国鲁王作为抗清旗帜。
郑芝龙为博洛诓骗然后被挟持往北之后，偌大的郑氏集团只有一部分人归降了清朝，其中对清廷心怀疑惧、坚持抗清的，还大有人在。
郑芝龙的兄弟郑鸿逵、郑芝龙的长子朱成功、郑芝龙的族人郑彩、郑联等人都拒绝接受大清统治，虽然他们或尊奉监国鲁王，或尊奉业已身亡的隆武帝，或尊奉广东的正统大明天子朱由桹，但无论尊奉谁的旗帜，他们都是活跃在福建一线的较大规模抗清势力。
值得一提的是，朱成功在其父郑芝龙从安平前往福州投降大清之时，坚决拒绝其父要其一同前往的要求，回信直言：“从来父教子以忠，未闻教子以贰。今吾父不听儿言，后倘有不测，儿只有缟素而已。”。
果不其然，在聪明一世糊涂一时的海贼王郑芝龙自投罗网以后，清军立即背信弃义，于隆武二年十一月末攻入郑氏老巢安平镇，大肆抢劫淫掠，朱成功的母亲翁氏也在被侵犯后愤而自缢，朱成功闻讯真可谓怒不可遏、痛不欲生，国仇家恨愈发坚定了他抗清的信念。
清兵饱掠而去之后，朱成功于十二月回到安平，料理完其母丧事，携所着衣巾，焚于文庙，仰天唏嘘，痛哭曰：“昔为孺子，今为孤臣，谨谢儒服，惟先师昭鉴！”，再拜孔夫子而去。
朱成功虽为郑芝龙长子，可愚蠢的郑芝龙送人头之后，郑氏集团群龙无首，可以说一度分崩离析，故朱成功一开始手头兵力并不多，其不得不与陈辉、洪旭等人，致力于在沿海招兵置船，意图先恢复郑氏海上雄风，再图匡扶大明。
朱由桹东征潮惠之后，命令罗方柏留镇潮州府，就这样，永历元年初，朱成功在前往潮州府南澳岛一带招募士卒之时，与罗方柏有所接触。
他也是从罗方柏这里得到了神宗嫡系子孙桂王朱由桹于广州登基的确切消息，鉴于朱由桹的确是大明皇室中最最正统的，而且听闻其登基两个多月，就御驾亲征击败李成栋、收服施福等人，如此乱世之下，朱成功也真的是对朱由桹这样的马上天子心存向往。
再加上朱成功看到驻守潮州的罗方柏练兵有方，而且潮州府的粮草相对来说更加充足，他迫切想要从潮州府这里得到他急需的粮草来养兵养船。
在这样的现实利益的驱动下，朱成功很快放弃了尊奉隆武帝，而是选择尊奉朱由桹这个明显更有前途的永历皇帝。
毕竟，就算隆武帝对他朱成功再好，终究都已经蒙难，人死不能复生，况且朱成功对和隆武帝有摩擦的鲁王朱以海有成见，实在不想尊奉鲁王。
总而言之，尊奉血脉最为正统的朱由桹，就是朱成功最合适的选择了。
自罗方柏这里得知关于朱成功的一系列消息后，朱由桹当即慷慨大方地让罗方柏给予朱成功粮食援助。
也正因为如此，拿人手短的朱成功对广州的永历朝廷更加有好感。