鉴于细川晴元的嫡男细川聪明丸仍在三好长庆的手中，清定并没有完全否定现任管领细川氏纲，避免三好长庆狗急跳墙。
当然，清定还命早就暗中臣从上杉家的小川城城主多罗尾光吉、雨乞山城城主藤林保丰二人派遣麾下忍者，对三好家、六角家治下的近江、山城、摄津、大和、和泉、河内等国进行大肆袭扰，尽可能的阻挠三好家、六角家征召军势、调集粮草，从而减轻上杉军上洛的阻力。
而另一方面，足利义辉、三好长庆、六角义贤、朝仓义景、赤松晴政、仁木义视、本愿寺显如等人可没有坐以待毙，他们深知上杉家的兵甲之盛，难以匹敌，便相互之间积极联系，并想方设法的拉拢更多的大名、国人领主们至己方，准备阻遏上杉家三道并进的势头。
尽管足利将军家的权威日益低下，但足利义辉还是与三好长庆、细川氏纲、六角义贤等人联名对西国新崛起的大名毛利元就发去祝贺，希望毛利家能够尽快稳定治下领国，并发兵上洛前来勤王。
为了表示诚意，足利义辉授予了毛利元就御相伴众的家格，以及朱柄伞、涂舆两样免许，直接让其拥有了守护格。
然而，不论伏见宫贞敦亲王（二条晴良岳父）、宽钦法亲王（劝休寺门迹，伏见宫贞敦亲王次男）、尧尊法亲王（妙法院门迹，伏见宫贞敦亲王三男）、任助法亲王（仁和寺门迹，伏见宫贞敦亲王
四男）二条晴良、九条稙通、高仓永家、广桥国光、薄以绪等皇室、公卿好说歹说，后奈良天皇就是反对指认上杉清定为朝敌。
加上时任关白近卫前嗣举族经近江朽木谷后逃入若狭，使得朝廷之中的亲上杉家一派公卿顿时失去了主心骨，根本无力阻止亲三好家一派的公卿擅意妄为。