异空间的魔神出现，打开了异空间，开始吞噬人类（参考盖亚的超空间波动怪兽，在偏僻的村庄，用他的电磁波让人疯狂，吸收心中的负面情绪，德班的意外出现，让一个村子幸存下来，从而让魔神的存在被发现）因为空间魔神出现，导致了时间空洞，从而引发了后续的事件

　　麦克斯炮和哉佩利敖光线共同攻击哥布纽（基加），将其炸的七零八散，但机械岛用表面装甲把碎片组合起来，（这也是奥古玛包裹着有机械岛外装甲的原因）迪迦被哥布纽抓住，并半陷入岛内，成了人质，在彩色计时器急速闪烁的情况下，迪迦施展了还未成熟的自爆炸弹，将自己和机械岛一起炸成了碎片，第一次直面死亡的千叶诚感到了恐

　　在距离克里莫斯诸岛八百公里、深度一千米的海底，发现了大规模的人工造物即露露耶遗迹，开始探查那里，发闪电人歼灭战，种族之间的战斗，无论最开始是谁的错，但只要你是人类，就必须站在人类的立场上基里艾洛德人被打败，使得一直默默注视地球的戴西斯星系基里艾洛德人通过行星联盟发布任务，要求强大的宇宙人里地球公开挑战迪迦，并且破坏，从而出现受害者有罪论:如若不是迪迦在地球，怎么会发生这样的事情

　　闪电人的多次出现，让等离子体暴走，地球空气中的电离子增多，被茜拉供养着的主人灵魂得以现身，求助想让茜拉不再那么痛苦玄凤鹦鹉茜拉如杜鹃啼血，迪迦将从人类那里获得的光，给了茜拉根津正亲物理学博士北海道能源开发研究所所人类对艾勃隆细胞的研究导致了大量地球怪兽的诞生，莫拉特王类导致怪兽出现，然后怪兽再报复人类怪兽因不同的原因而苏醒，但每次消灭他们的理由都是一样的，这个世界并没有怪兽的容身之地它并不想伤害任何人，它想存在着，找个可以容纳它的地方。很可惜，这个世界不存在它的容身之处，因为它的存在即是错误。

　　娜迦人停止进攻，就像劫匪手里的枪，只有开火才知道真假，恐龙人知道了人类想消灭闪电人，因此恐龙人放弃了和人类商谈的天真想法，被炼金术扭曲了时空，去往了艾克斯的世界，成了个无名的编剧根本不相信人类会和恐龙人和谐相处。飞船里是一群娜迦人的难民，母星被庞大的斯菲亚母体吞噬，仓皇逃窜。（之前的生活在地球上的蜥蜴人，被黑暗支配者灭亡，逃离了故土